1 git-versiohallinta

Mikäli A) käytät R:ää tai muuta skriptattavaa (vs. valikkopohjainen) ohjelmaa datan analysoimisessa, ja kirjoitat B) analyysit tekstimuotoisiin (plain text) tiedostoihin kuten Rmarkdown, on versiohallinnan (revision control / version control) käyttöönotto on erinomainen idea.

Miksi?

• oman työn ja tiedonhallinnan “kestävyys” (sustainable software and data management practises)
• oppiminen ja kontribuoiminen tutkimusprojekteihin ja tutkimusohjelmistoihin (git + github/gitlab on tällä hetkellä se infrastruktuuri, jossa kehitystyö pitkälti tapahtuu)
• tieteen avoimuus ja toistettavuus (reproducibility)
  • datat & analyysit (julkaisut jo on osin avoimia ja asia on ns. prosessissa)
  • analyysien (ohjelmistojen) tekeminen viitattaviksi
  • datojen dokumentointi, lisensointi ja esillepano

2 Oppaita

• https://www.youtube.com/watch?v=U8GBXvdmHT4 - aloita tästä 54 minuuttia
• https://try.github.io/levels/1/challenges/1 sitten tämä - 15 minuttia
• https://guides.github.com/
• https://www.youtube.com/githubguides
• https://git-scm.com/book/fi/v1/Alkusanat-Versionhallinnasta
• http://happygitwithr.com
• https://beta.rstudioconnect.com/jennybc/happy-git-with-r/
• Greg Wilson, Jennifer Bryan, Karen Cranston, Justin Kitzes, Lex Nederbragt, Tracy K. Teal (2016) Good Enough Practices in Scientific Computing
• TIE-02200 Ohjelmoinnin peruskurssi S2015: Git ja versionhallinta